В пресс-службе Центрального университета сообщили, что ученые разработали вычислительный метод для поиска генов, связанных с развитием рака прямой и толстой кишки. Алгоритм позволяет получить проверяемые гипотезы за несколько часов вычислений.
Метод учитывает взаимодействие ДНК и РНК, активность генов и расположение суперэнхансеров, которые могут усиливать работу генов. Исследователи проверили подход на длинной некодирующей РНК SNHG1, число копий которой повышается при этих видах рака.
Алгоритм выделил 12 потенциальных генов-мишеней. Их активность была выше в опухолевой ткани пациентов и коррелировала с уровнем SNHG1, отметили в пресс-службе.
Среди найденных участков оказался ген TOP1, уже используемый как мишень при химиотерапии рака прямой и толстой кишки. Ученые считают, что метод позволит быстрее выбирать направления для экспериментальной проверки новых противоопухолевых препаратов.
Источник: www.ferra.ru