Цари зверей поделились с учеными самым сокровенным: их кишечник оказался домом для сотен неизвестных науке микроорганизмов.
Ученые обнаружили сотни ранее неизвестных геномов бактерий и вирусов, изучив экскременты диких африканских львов. Исследование показало, насколько мало наука знает о микроорганизмах, которые живут внутри хорошо изученных животных. Находки помогут разобраться в пищеварении, обмене веществ и здоровье больших кошек.
Работа опубликована в журнале Animal Microbiome. Исследователи изучили 23 свежих образца экскрементов, собранных у 20 львов в национальном парке Этоша в Намибии.
420 геномов из львиного кишечника: наука не знает всех жильцов
Анализ ДНК позволил ученым восстановить 318 геномов бактерий и 102 генома вирусов. Большинство из них заметно отличались от генетических последовательностей, уже собранных в международных базах данных. Исследователи столкнулись с большим количеством ранее не описанных видов микроорганизмов.
Причина такого пробела — недостаток исследований микробиома диких животных. В отличие от человека, чьи микробы изучены гораздо подробнее, львы остаются малоизученной территорией для геномики.
Масштаб работы оказался внушительным даже по вычислительным меркам: обработка данных потребовала десятков тысяч часов работы процессоров, результатом стали десятки терабайт информации.
Чтобы представить масштаб задачи, достаточно вообразить тысячи пазлов, перемешанных в одной комнате. Часть деталей потеряна, часть повреждена, а некоторые повторяются. Именно так специалисты по биоинформатике собирают фрагменты ДНК в геномы разных живых организмов.
Источник: hi-tech.mail.ru