У фермента-«охотника» нашли молекулярный «якорь». Без него атака на бактерию заметно слабеет. Открытие может пригодиться в создании нового поколения ферментных антибиотиков.
Антимикробный фермент Blp получил своеобразную «систему наведения». Исследователи обнаружили в его структуре небольшой участок, который помогает белку сначала закрепиться на клеточной стенке бактерии, а уже затем запустить разрушительную реакцию. Важнейшими элементами этого молекулярного «якоря» оказались два аминокислотных остатка — тирозин в положении 160 и аспарагин в положении 136.
Исследование провели ученые Института биохимии и физиологии микроорганизмов имени Скрябина РАН вместе с коллегами из Сколковского института науки и технологий и Института белка РАН. Результаты работы опубликованы в International Journal of Molecular Sciences.
Сначала найти врага — потом разрушить ее стенку
Фермент Blp вырабатывает бактерия-паразит перцев Lysobacter capsici. В природе такие молекулы помогают ей конкурировать с другими микроорганизмами за пространство и ресурсы. По сути, Blp можно назвать частью химического арсенала бактерии.
Для исследователей этот фермент особенно интересен по другой причине. Он способен разрушать клеточные стенки грамположительных бактерий, в том числе некоторых потенциально опасных для человека микроорганизмов. Такие ферменты рассматриваются как возможные инструменты для создания новых антимикробных средств на фоне распространения устойчивости к антибиотикам.
Механизм действия Blp на базовом уровне был известен: фермент расщепляет пептидогликан — прочную сетчатую структуру, которая поддерживает форму клеточной стенки многих бактерий. Но оставался важный вопрос: как молекула находит нужную поверхность и удерживается на ней достаточно долго, чтобы начать разрушение? Ответ, как выяснилось, скрывался в отдельном участке белка.
Источник: hi-tech.mail.ru