Ученые из Хиросимского университета представили новый инструмент, который позволяет определять функции генов грибов даже в тех случаях, когда у исследуемого вида нет эталонного генома. Об этом сообщает издание Journal of Fungi со ссылкой на исследование японских биологов.
Сегодня широко используется метод РНК-секвенирования (RNA-seq), который показывает, какие гены активны в организме. Однако понять, за что именно отвечают эти гены у грибов, долгое время оставалось сложной задачей. Причина — в огромном разнообразии грибов и недостатке качественных геномных данных для большинства видов. Царство Грибы (лат. Fungi) часто называют называть темной материей биологии.
Новый подход решает эту проблему: он анализирует полученные РНК- и ДНК-данные и формирует подробную таблицу функций генов. Это позволяет проводить более точный сравнительный анализ и выявлять биологически значимые различия между условиями или видами.
Новый взгляд на генетику грибов
Грибы остаются одной из самых малоизученных таксонов живых организмов. По оценкам, науке известно лишь около 148 тысяч видов, тогда как их реальное число согласно компьютерным моделям может достигать 3,8 млн.
Многие существующие биоинформатические инструменты создавались «под все виды сразу» и плохо учитывают уникальные особенности конкретных грибов. Новый метод, напротив, ориентирован именно на их генетическую специфику, что делает его особенно ценным для микологии и экологии.
Кроме фундаментальной науки, разработка может ускорить поиск новых лекарств, ферментов и биотехнологических решений. Ранее, например, ученые уже использовали генетические инструменты для «вскрытия» тайных способностей грибов и поиска полезных соединений.
Недавно мы сообщили о том, что смертоносный почвенный грибок поставил водяных драконов на грань вымирания.
Источник: hi-tech.mail.ru