Новый метод анализа ДНК речных выдр по экскрементам позволяет изучать редкий вид без стресса и вмешательства в среду обитания.
Исследователи из университета Кардиффа разработали новый способ изучения генетики евразийских выдр (Lutra lutra), не прибегая к их отлову. Результаты работы опубликованы в журнале Royal Society Open Science.
Традиционные методы изучения ДНК редких видов предполагают временный отлов и забор тканей, что вызывает стресс у животных и требует значительных ресурсов. Особенно это проблематично для скрытных видов, к которым относится выдра.
Новый подход основан на анализе экскрементов животных. Ученые собрали 27 образцов на реке Уск в Уэльсе и извлекли из них генетический материал, используя методы метагеномики и биоинформатики.
ДНК из биоследов: как работает метод
Ключевую роль сыграла технология так называемого shotgun-секвенирования, позволяющая собрать полный геном из множества случайных фрагментов ДНК. В результате исследователям удалось восстановить митохондриальные геномы выдр в 20 из 27 образцов.
Полученные данные совпали с результатами предыдущих исследований, где использовались ткани животных, что подтвердило точность нового метода. Кроме того, оказалось, что более свежие образцы (менее суток) и собранные весной дают более качественные результаты. Метод также потенциально позволяет изучать рацион животных и состояние их популяций без вмешательства в экосистему.
Евразийская выдра — вид, серьезно пострадавший от охоты, загрязнения вод и разрушения среды обитания. Новый подход может существенно облегчить мониторинг таких животных и снизить риски для их популяций.
Источник: hi-tech.mail.ru