Ученые Санкт-Петербургского государственного университета (СПбГУ) создали программу для обработки результатов анализа геномов микроорганизмов в биологических материалах. Разработка единственная в мире учитывает особенности российского микробиома, сообщили в пресс-службе вуза.
«Граждане каждой страны отличаются друг от друга наличием тех или иных бактерий и их численностью. До недавнего времени приходилось анализировать микрофлору россиян на основе данных из других стран, так как сведений о микробиоме нашей страны не было. Мы исправили эту ситуацию», — привели в пресс-службе слова младшего научного сотрудника кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ Лаврентия Данилова.
Уточняется, что анализ бактериальной флоры назначают при инфекциях, чтобы точно определить патоген и начать прицельную терапию. Установить возбудителя стандартными методами, например, с помощью бакпосева или ПЦР, получается не всегда. В таких случаях врачи прибегают к метагеномному секвенированию — анализу микробного сообщества в биологических материалах на основе определения выделенной из образца последовательности ДНК.
По данным пресс-службы, разработка ученых — программа Antimicro, которая обрабатывает загруженные пользователем данные, а затем формирует заключение. В нем отражаются сведения о том, сколько бактерий и каких видов содержится в образце, какой у них уровень антибиотикорезистентности.
Источник: hi-tech.mail.ru