В эксперименте 63 из 100 образцов оказались активны против устойчивых патогенов.
Луис Педро Коэльо (Luis Pedro Coelho) из Квинслендского технологического университета с коллегами из пяти стран проанализировал с помощью машинного обучения датасет из 63410 метагеномов и 87920 геномов прокариот (как свободноживущих, так и связанных с многоклеточными организмами-хозяевами). В итоге они составили каталог AMPSphere, в который вошли 863498 неизбыточно повторяющихся потенциальных антимикробных пептидов, и большинства из них в имеющихся базах данных нет. Отчет о работе опубликован в журнале Cell.
В качестве подтверждения концепции исследователи синтезировали и испытали in vitro и in vivo 100 предсказанных пептидов, потенциально активных в отношении клинически значимых патогенов, а также комменсалов человеческой кишечной микробиоты. Из них 79 показали антимикробную активность, причем 63 действовали прицельно на высокопатогенные антибиотикоустойчивые бактерии ESKAPEE. В экспериментах на мышах с абсцессом кожи их действие напоминало эффект применяемого в клинической практике пептидного антибиотика полимиксина B.
Источник: habr.com
